全世界首款云计算技术服务平台来了!

2021-03-22 15:21 jianzhan

全世界首款云计算技术服务平台来了!


,这个时尚潮流的IT术语和性命科学研究有啥关联?试验技术性的持续自主创新,使科学研究经营规模和可得到的数据信息量急剧扩增,当一般试验室测算工作能力已不够以应对日趋巨大的数据信息剖析时,云计算技术出示掌握决之道。首个新1代测序云计算技术的诞生,不单将有助于处理数据信息短板难题,更加将来的试验室数据信息剖析指出新的方位。

自从人类遗传基因组方案以来,测序技术性的发展可以说飞速发展。以往倾全球之力也必须耗时近10年才可以进行的人类遗传基因组测序,现如今的新1代测序只需数天便可进行。可是,新1代测序(NGS)系统软件的最大挑戰之1是必须高特性的测算设备,以适用(巨大的)数据信息剖析和存储。构想,以100⑵00bp的编码序列读长,要拼接出全部遗传基因组,那必须多么的巨大的数据信息剖析和储存!以华大遗传基因为例,仅仅是数据信息剖析就号称有3000人的精英团队。一般试验室哪里能有这个测算工作能力!如何办?

云计算技术处理之道

影响力,为将新1代测序技术性普及到一般经营规模试验室,又推出小型新1代测序Miseq.深明数据信息剖析是新1代测序技术性之短板,清晰地了解到一般试验室缺乏高特性测算设备适用巨大的数据信息剖析和存储,Illumina全新推出了为微生物学家打造的新1代测序云计算技术服务平台 BaseSpace.有了BaseSpace,试验室就可以够省去维护保养IT机器设备带来的花费,从而更潜心于科学研究。

1键式的剖析专用工具,简化的数据信息剖析,可迅速轻轻松松地查询結果,而不用专业的微生物信息内容学資源。在MiSeq? 操纵手机软件(MCS)中,只需在测序运作刚开始时挑选应用BaseSpace来存储和剖析。MiSeq仪器将数据信息从仪器无缝拼接消息推送到云端 BaseSpace,开展全自动化的剖析和存储,马上与协作者随时随地共享资源数据信息,并存储无尽的数据信息。另外可挑选保存数据信息,开展当地代管和剖析。制造行业规范的数据加密可出示安全性确保。

在设计方案中充足考虑到到微生物学家的要求,BaseSpace1键式微生物信息内容学运用程序流程可以说简易易用,能从初始数据信息中造成微生物学有关且可实际操作的結果。BaseSpace輸出文档是制造行业规范的,选用对外开放的文件格式,如bam(精准定位和比对)、vcf(变异体检出)、fastq(初始载入)和text文件格式。有了这些文档文件格式,您能将BaseSpace数据信息轻轻松松导入您钟爱的科学研究手机软件专用工具开展进1步剖析。

简化的数据信息剖析

从业新1代测序的试验室一般必须1位训炼有素的微生物信息内容学家来进行数据信息剖析。BaseSpace运用云端手机软件运用程序流程,可协助完成全自动化的微生物信息内容学剖析。BaseSpace现阶段有着6个单独的数据信息剖析运用程序流程:重测序、扩增子测序、16S宏遗传基因组、de novo安装(由Velvet适用)、小分子结构RNA和文库QC.运用Illumina Experiment Manager(Illumina试验管理方法器),在样品表设定时挑选好所需的剖析,运作刚开始后数据信息就立即传送到BaseSpace.1旦测序运作进行,BaseSpace全自动刚开始运作特定的剖析,不用客户干涉。剖析在几小时内进行,并全自动转化成汇报。另外,Illumina还可能再次加上內部开发设计和微生物信息内容学小区开发设计的运用程序流程。这将进1步拓展简易、订制数据信息剖析的挑选。

全世界经营规模的数据信息协作

有了云端初始和汇总数据信息,BaseSpace客户可马上与走廊那头或遍及全世界的协作者共享资源数据信息。与别的BaseSpace客户共享资源数据信息非常简易明了。现阶段有两种挑选:根据连接共享资源(Sharing by Link)和根据姓名共享资源(Sharing by Name)。根据连接共享资源容许数据信息有着者建立1个与众不同的连接,推送给协作者。数据信息有着者可删掉此连接,并掌握谁点一下了连接和查询了数据信息。根据姓名共享资源将是1个更非常容易设定的方式,数据信息有着者只需管理方法1份客户电子器件电子邮件目录,便可操纵谁有权浏览数据信息。

提高的安全性性

在决策是不是将遗传基因组数据信息移到云端剖析和存储时,安全性性相当关键。根据物理学、电子器件和行政对策,全部的数据信息可获得合理维护。提交数据信息根据AES256规范数据加密,并遭受SSL维护。BaseSpace中的数据信息代管在Amazon Web Services(AWS)中,它合乎各种各样制造行业认同的安全性性规范1.Amazon全面且历经制造行业检测的服务平台安全性性方式,保证BaseSpace可考虑、乃至跨越了绝大多数组织机器设备的安全性性规定。

持续跨越,才可以生生不断。Illumina自主创新的BaseSpace云计算技术服务平台,不单能与MiSeq?系统软件及别的的Illumina测序服务平台立即整合,是数据信息剖析、存储和共享资源的理想化云计划方案,更关键的实际意义在于,为未来的试验室数据信息剖析提醒了1种新的方式, 云储存 云剖析 云计算技术 服务将在性命科学研究行业日趋普及,也许不远的未来,还会有 云试验 !


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